Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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