Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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