Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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