Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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