Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
ATRQ13535 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ATRQ13535 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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