Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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FOXE3Q13461 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXE3Q13461 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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