Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CBX3Q13185 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CBX3Q13185 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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