Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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