Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FOXI1Q12951 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms