Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COX10Q12887 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms