Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms