Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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