Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms