Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREMQ03060 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREMQ03060 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms