Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms