Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms