Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms