Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms