Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2C1P98194 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms