Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ELF3P78545 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms