Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HBBP68871 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms