Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-24P63145 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-24P63145 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-24P63145 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-24P63145 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-24P63145 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-24P63145 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-24P63145 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms