Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms