Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF3P61204 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF3P61204 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF3P61204 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF3P61204 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF3P61204 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF3P61204 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF3P61204 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms