Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSCP56915 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSCP56915 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSCP56915 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSCP56915 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSCP56915 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSCP56915 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSCP56915 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSCP56915 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSCP56915 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GSCP56915 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSCP56915 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSCP56915 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GSCP56915 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms