Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN8P56748 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms