Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAD23AP54725 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms