Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms