Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC1P35052 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms