Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms