Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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