Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms