Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 Z97198.1-201ENST00000452366 658 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 AC131934.1-201ENST00000527799 912 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 AL354892.3-201ENST00000586101 1630 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB1P14653 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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