Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms