Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms