Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYBBP04839 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYBBP04839 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYBBP04839 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYBBP04839 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYBBP04839 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms