Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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