Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLPXO76031 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPXO76031 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPXO76031 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPXO76031 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLPXO76031 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLPXO76031 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPXO76031 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLPXO76031 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLPXO76031 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLPXO76031 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLPXO76031 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLPXO76031 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPXO76031 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPXO76031 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLPXO76031 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPXO76031 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPXO76031 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPXO76031 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPXO76031 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPXO76031 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLPXO76031 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPXO76031 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPXO76031 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPXO76031 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPXO76031 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPXO76031 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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