Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DCTN3O75935 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCTN3O75935 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms