Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA10O75578 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA10O75578 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA10O75578 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA10O75578 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA10O75578 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA10O75578 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA10O75578 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA10O75578 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA10O75578 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA10O75578 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA10O75578 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA10O75578 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA10O75578 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGA10O75578 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGA10O75578 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms