Protein–RNA interactions for Protein: O75368

SH3BGRL, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRLO75368 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BGRLO75368 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRLO75368 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms