Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PHF1O43189 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PHF1O43189 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PHF1O43189 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PHF1O43189 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PHF1O43189 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PHF1O43189 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PHF1O43189 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PHF1O43189 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PHF1O43189 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PHF1O43189 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PHF1O43189 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PHF1O43189 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PHF1O43189 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PHF1O43189 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHF1O43189 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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