Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBXN8O00124 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms