Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms