Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms