Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP11Q9Y3A2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms