Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRPF3Q9ULD4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms