Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPC1L1Q9UHC9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms