Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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UPB1Q9UBR1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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UPB1Q9UBR1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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UPB1Q9UBR1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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UPB1Q9UBR1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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UPB1Q9UBR1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPB1Q9UBR1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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