Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms